据目前学术界的研究和权威博物馆的收藏记录，吕纪的真迹存世量大约在几十件左右，具体数字难以精确统计。这些作品大多收藏于国内外的博物馆、美术馆以及私人藏家手中。例如，北京故宫博物院、上海博物馆、台北故宫博物院等都藏有吕纪的作品，但其中真正被确认为吕纪亲笔的真迹数量极为有限。
由于吕纪的作品在历史上曾被大量仿制，尤其是明清时期，许多伪作混杂其中，给鉴定工作带来了极大困难。因此，即使是权威机构也需通过笔墨风格、题款、印章、纸张材质等多方面进行细致分析，才能确定一幅作品是否为吕纪的真迹。
此外，近年来随着艺术品市场的兴起，一些吕纪的赝品流入市场，进一步增加了辨别真伪的难度。因此，对于吕纪真迹的认定，不仅需要专业的美术史研究者参与，还需要结合科技手段如红外线检测、显微摄影等进行辅助判断。
总的来说，吕纪的真迹存世量极少，每一件都是珍贵的艺术遗产。对于研究明代花鸟画的发展、了解吕纪的艺术风格以及推动中国传统文化的传承，都具有重要意义。